1.印制要求不同。根据规定专票由国务院税务主管部门指定的企业印制。

2.发票使用人不同。专票一般只能由一般纳税人使用，小规模纳税人需要使用专票只能由税务机关代开。普通发票即使是未办理税务登记的纳税人也是可以使用的。

3.内容不同。专票除了有普通发票所具备的内容外，还包括纳税人税务登记号、不含增值税金额、适用税率、应纳增值税额等内容。

4.联次不同。专票有四个联次和七个联次两种，普通发票只有三联。

5.作用不同。专票可以进行认证抵扣，而普通发票除运费、收购农副产品、废旧物资等可作抵扣外，其他的一律不可以。

专用发票和普通发票的税率

(1)小规模纳税人增值税(税率为3% )：应纳增值税额=含税销售额÷(1+3%)×3%;

(2)一般纳税人的增值税(税率为17% ) ：应纳税额=(不含税销售额-不含税进货金额) × 17% 。